小鼠基因组中的一段病毒DNA使早期胚胎中的细胞具有分化成体内几乎任何细胞类型的潜力
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图中展示了一个DNA分子,并突出显示了其中的特定部分。

一项研究表明,古代病毒感染遗留的DNA对胚胎发育至关重要。 (图片来源:fotograzia via Getty Images)

小鼠基因组中的一段病毒DNA使早期胚胎中的细胞具有分化成体内几乎任何细胞类型的潜力。

一项研究表明,古代病毒感染遗留的DNA对胚胎发育至关重要。 (图片来源:fotograzia via Getty Images)

最新研究表明,小鼠基因组中一段由古代病毒感染留下的DNA片段对子宫内的早期发育至关重要。

根据去年12月发表在《科学进展》(Science Advances)杂志上的这项研究,这种病毒DNA能够激活基因,使早期小鼠胚胎中的细胞具备分化成体内几乎任何细胞类型的潜能。这种病毒DNA——被称为MERVL——本身会被一种名为“Dux转录因子”的蛋白质激活,该蛋白质会与病毒DNA序列结合,从而启动胚胎发育。

虽然Dux蛋白在子宫内发挥着重要作用,但如果其活性持续时间过长,就会杀死细胞。人类版本的Dux蛋白,称为DUX4,由于其基因序列的异常,会导致其在肌肉细胞中过度活跃,从而引发进行性肌肉萎缩症。这种遗传性疾病被称为面肩肱型肌营养不良症(FSHD),目前尚无治愈方法。

这项新研究不仅揭示了MERVL和Dux在子宫内的作用,还详细阐述了这些基因在日后生活中可能产生的有害影响。鲁汶大学(KU Leuven)的博士后研究员谢里夫·霍迪尔(Sherif Khodeer)表示,这是一项“重要的研究”。霍迪尔主要研究干细胞和发育生物学,但他并未参与这项研究。

一种强大的基因编辑工具

英国医学研究委员会医学科学实验室的研究人员利用一种名为 CRISPR 激活(CRISPRa)的基因编辑工具,揭示了 Dux 和 MERVL 之间的密切关系。与传统的CRISPR 技术(通过切割 DNA 来改变其编码)不同,CRISPRa 能够在不改变 DNA 序列的情况下增强特定基因的活性。

研究团队利用 CRISPRa 技术分别激活小鼠胚胎干细胞中的 Dux 或 MERVL 基因。这使得研究人员能够探究每个因子如何影响早期胚胎发育。

当研究人员仅激活MERVL时,干细胞表现出“全能性”,即分化成任何细胞类型的能力——这是早期胚胎的一个重要特征。但研究人员发现,这些细胞缺少一些关键特征。这表明,虽然MERVL在小鼠早期胚胎发育中发挥着重要作用,但Dux也是必需的。

另一方面,单独激活Dux则产生了更接近天然早期胚胎细胞的细胞。因此,研究人员认为Dux能够独立于MERVL激活胚胎发育所需的基因。

由于Dux和MERVL在胚胎发育早期阶段密切相关,科学家们此前怀疑MERVL也可能在Dux日后造成的有害影响中发挥作用。但这项新研究表明事实并非如此。

研究人员通过观察Dux对含有和不含NOXA基因的干细胞的影响,来测试Dux如何造成细胞损伤。NOXA基因已知参与由多种应激因素引发的细胞死亡。他们发现Dux会激活NOXA基因,从而产生一种触发细胞死亡的蛋白质。当研究团队去除NOXA基因后,Dux造成的损害显著降低。这表明,导致毒性的罪魁祸首是NOXA基因,而非MERVL。

潜在的治疗靶点

研究作者认为,已知NOXA在FSHD(一种人类肌肉萎缩疾病)患者体内水平升高。他们推测,开发一种抑制NOXA的药物可能有助于预防该疾病中的细胞死亡,从而提高肌肉细胞的存活率。

“面肩肱型肌营养不良症是一种复杂的疾病,”该研究的资深作者、医学研究委员会医学科学实验室染色质和发育小组负责人米歇尔·珀查德在一份声明中说。

她解释说:“尽管患者的所有细胞都发生了导致疾病的基因改变,但只有一部分细胞会激活DUX4。了解是什么触发了肌肉细胞中DUX4的激活,以及这种激活与早期发育阶段的激活有何不同,是我们希望在未来研究中探索的关键问题。”

Khodeer表示,比较小鼠Dux和人类DUX4的功能“很有价值”,并补充说,未来的研究还应该探索MERVL如何精确控制附近的基因,以及MERVL在小鼠胚胎发育过程中何时以及如何被关闭。

至关重要的是,霍迪尔指出,MERVL并不存在于人类基因组中。但科学家们怀疑,人类基因组的某些部分可能与MERVL等效。与小鼠的情况类似,这些DNA片段是远古病毒感染遗留下来的。

霍迪尔表示,这些新发现引发了几个问题。例如,人类早期胚胎的发育机制是否与小鼠相同?人类体内哪些古老的病毒DNA片段可能在发育早期阶段发挥类似于MERVL的作用?他在给Live Science的一封电子邮件中写道:“解答这些问题或许能够阐明物种间早期发育调控的差异。”

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xuanzhang
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